Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP12-1P59990 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms