Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDE6CP51160 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE6CP51160 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms