Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRB2P47870 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRB2P47870 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRB2P47870 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRB2P47870 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRB2P47870 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms