Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NCAPD3P42695 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NCAPD3P42695 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NCAPD3P42695 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms