Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CAPGP40121 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CAPGP40121 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPGP40121 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPGP40121 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms