Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SKAP2O75563 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms