Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRBOX1C9JBD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms