Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GJA3Q9Y6H8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJA3Q9Y6H8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms