Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBB2BQ9BVA1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBB2BQ9BVA1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms