Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms