Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYRIPQ8NFW9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYRIPQ8NFW9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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