Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MALRD1Q5VYJ5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MALRD1Q5VYJ5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms