Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRAPPC3LQ5T215 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRAPPC3LQ5T215 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms