Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4orf17Q53FE4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4orf17Q53FE4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms