Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.023e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.843e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 227.47■■□□□ 1.999e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.799e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.799e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 322.53■■□□□ 1.29e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.999e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.219e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.871e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C11orf58-210ENST00000531658 4258 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.481e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C11orf58-203ENST00000524461 2040 ntTSL 24.87□□□□□ -1.631e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.64■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.029e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C1orf43-207ENST00000470180 1861 ntTSL 518.92■□□□□ 0.622e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.552e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.222e-7■■■■□ 24
PABPC4Q13310 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.782e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.272e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 AC068631.2-201ENST00000418776 501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.212e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 DNAJB11-204ENST00000495390 4079 ntTSL 27.73□□□□□ -1.172e-9■■■■□ 24
PABPC4Q13310 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)12.06□□□□□ -0.484e-8■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.794e-8■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.726e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.332e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL19-204ENST00000453233 475 ntTSL 36.82□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL19-206ENST00000492255 359 ntTSL 36.63□□□□□ -1.352e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.11e-8■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL20-204ENST00000487659 1693 ntTSL 218.01■□□□□ 0.471e-8■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPL20-206ENST00000493287 504 ntTSL 29□□□□□ -0.971e-8■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 RPS15A-206ENST00000569083 1022 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-52■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 RPL13-212ENST00000563749 2367 nt24.3■■□□□ 1.484e-42■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.734e-42■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 RPL13-207ENST00000484610 924 ntTSL 517.86■□□□□ 0.454e-42■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 ARHGAP4-217ENST00000466928 840 ntTSL 222.72■■□□□ 1.232e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 L1CAM-212ENST00000464967 593 ntTSL 216.15■□□□□ 0.182e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 RPL35-205ENST00000495728 649 ntTSL 219.37■□□□□ 0.694e-69■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 DCTN2-215ENST00000550201 1527 ntTSL 515.11■□□□□ 0.014e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.891e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.41e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.39e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.929e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.929e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.39e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-205ENST00000505125 3180 ntTSL 1 (best)14.93□□□□□ -0.029e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-213ENST00000514543 1465 ntTSL 55.98□□□□□ -1.459e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-204ENST00000504094 2177 ntTSL 25.86□□□□□ -1.479e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 FIP1L1-211ENST00000513008 1070 ntTSL 1 (best)4.42□□□□□ -1.79e-10■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.295e-8■■■■□ 23.9
PABPC4Q13310 STARD10-209ENST00000537351 426 ntTSL 39.75□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 GUK1-218ENST00000469973 795 ntTSL 231.15■■■□□ 2.587e-11■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 PSMD13-211ENST00000532025 653 ntTSL 320.41■□□□□ 0.861e-7■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.327e-9■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 ATP6AP1-209ENST00000491569 2079 ntTSL 223.1■■□□□ 1.297e-9■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 ATP6AP1-207ENST00000455205 4515 ntTSL 216.97■□□□□ 0.317e-9■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-9■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 SSSCA1-204ENST00000527413 532 ntTSL 216.49■□□□□ 0.234e-9■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 STARD8-205ENST00000523864 4864 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 MRPL11-205ENST00000528272 506 ntTSL 37.04□□□□□ -1.281e-8■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-72■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.432e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.262e-6■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 NOP53-209ENST00000599253 689 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-15■■■■□ 23.8
PABPC4Q13310 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.525e-13■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.35e-13■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-13■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MRPL27-206ENST00000511860 869 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MRPL27-205ENST00000508200 636 ntTSL 313.05□□□□□ -0.322e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MRPL27-204ENST00000507088 732 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 MRPL27-202ENST00000442592 2441 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.72e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 PSMD13-205ENST00000526783 892 ntTSL 512.97□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-212ENST00000580322 1558 ntTSL 525.49■■□□□ 1.674e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.494e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.477e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-224ENST00000584557 2000 nt24.1■■□□□ 1.454e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 UBXN1-212ENST00000531625 542 ntTSL 223.48■■□□□ 1.354e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.356e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 UBXN1-211ENST00000531056 560 ntTSL 422.78■■□□□ 1.244e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 UBXN1-203ENST00000436354 592 ntTSL 222.69■■□□□ 1.224e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.187e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-201ENST00000293208 1272 ntTSL 520.64■□□□□ 0.894e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 ZDHHC14-202ENST00000341375 1934 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-221ENST00000583536 1000 ntTSL 319.53■□□□□ 0.724e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.284e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 SAP30BP-217ENST00000582022 2409 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.214e-10■■■■□ 23.7
PABPC4Q13310 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.24e-10■■■■□ 23.7
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