Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCL20P78556 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL20P78556 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL20P78556 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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