Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ERVFRD-1P60508 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms