Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RPL28P46779 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RPL28P46779 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPL28P46779 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RPL28P46779 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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