Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ZNF544-219ENST00000602260 552 ntTSL 412.82□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-203ENST00000594384 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-211ENST00000597564 480 ntTSL 312.8□□□□□ -0.363e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 AC020915.6-201ENST00000637233 3042 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 ZNF544-205ENST00000596597 573 ntTSL 312.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 28.9
GTF2F1P35269 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-211ENST00000597706 1834 ntTSL 522.45■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-208ENST00000595908 1750 ntTSL 520.7■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-213ENST00000598626 619 ntTSL 317.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-203ENST00000537722 619 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-205ENST00000594500 523 ntTSL 317.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPR108-204ENST00000594034 778 ntTSL 313.58□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.511e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-204ENST00000449879 580 ntTSL 318.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-206ENST00000452814 804 ntTSL 517.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-202ENST00000412256 558 ntTSL 215.89■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.82□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 RAB11FIP3-211ENST00000495663 529 ntTSL 210.71□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 BCAT2-204ENST00000593515 1664 ntTSL 518.48■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SLC5A9-204ENST00000441260 1046 ntTSL 217.82■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SLC5A9-202ENST00000425816 1950 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SLC5A9-203ENST00000438567 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.431e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SLC5A9-206ENST00000493837 3769 ntTSL 211.06□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 DENND4A-208ENST00000568515 2655 ntTSL 225.8■■□□□ 1.722e-10■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 DENND4A-206ENST00000564674 3389 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.082e-10■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.342e-10■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.912e-10■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.076e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-212ENST00000599256 927 ntTSL 226.02■■□□□ 1.766e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.476e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-219ENST00000555987 557 ntTSL 423.65■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-221ENST00000556600 751 ntTSL 323.65■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SERTAD2-202ENST00000476805 1068 ntTSL 322.59■■□□□ 1.216e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.886e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-204ENST00000587096 1065 ntTSL 520.44■□□□□ 0.866e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 WDR27-208ENST00000479310 1289 ntTSL 520.22■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-211ENST00000590216 789 ntTSL 519.29■□□□□ 0.686e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 518.62■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-207ENST00000587915 540 ntTSL 418.41■□□□□ 0.546e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 518.36■□□□□ 0.536e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.496e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-211ENST00000598814 550 ntTSL 1 (best)17.95■□□□□ 0.466e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GYS1-203ENST00000457974 718 ntTSL 317.81■□□□□ 0.446e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 517.62■□□□□ 0.416e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-203ENST00000586357 482 ntTSL 416.54■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.181e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-213ENST00000554818 552 ntTSL 316.08■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-215ENST00000592369 528 ntTSL 315.33■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-215ENST00000555307 1039 ntTSL 515.13■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 FUT10-205ENST00000518076 1221 ntTSL 414.97□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-209ENST00000554315 1740 ntTSL 1 (best)14.95□□□□□ -0.021e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-230ENST00000557774 847 ntTSL 214.48□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 TMEM161A-214ENST00000592147 347 ntTSL 514.36□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 FUT10-211ENST00000524021 2042 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.226e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-222ENST00000556700 529 ntTSL 413.2□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 FUT10-209ENST00000520767 1623 ntTSL 1 (best)12.99□□□□□ -0.336e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.336e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-207ENST00000596273 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.526e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-206ENST00000553415 694 ntTSL 411.52□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-202ENST00000356296 3453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-201ENST00000430157 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.686e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 UBA52-205ENST00000595683 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.726e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 GPC3-203ENST00000406757 836 ntTSL 28.99□□□□□ -0.976e-8■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-210ENST00000554394 954 ntTSL 38.92□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 NUMB-220ENST00000556112 568 ntTSL 45.11□□□□□ -1.591e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.332e-9■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 ARHGEF1-210ENST00000594521 826 ntTSL 519.53■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.034e-14■■■■■ 28.8
GTF2F1P35269 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.595e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.585e-7■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.138e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-220ENST00000584634 588 ntTSL 419.61■□□□□ 0.738e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-205ENST00000577411 562 ntTSL 519.55■□□□□ 0.728e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-211ENST00000580050 476 ntTSL 419.55■□□□□ 0.728e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-217ENST00000583210 512 ntTSL 417.38■□□□□ 0.378e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.318e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.248e-12■■■■■ 28.7
GTF2F1P35269 NFE2L1-208ENST00000579537 372 ntTSL 413.43□□□□□ -0.268e-12■■■■■ 28.7
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 345 ms