Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PGCP20142 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PGCP20142 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGCP20142 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGCP20142 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PGCP20142 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PGCP20142 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PGCP20142 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PGCP20142 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PGCP20142 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms