Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VAV1P15498 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
VAV1P15498 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAV1P15498 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAV1P15498 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAV1P15498 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
VAV1P15498 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAV1P15498 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAV1P15498 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAV1P15498 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAV1P15498 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAV1P15498 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
VAV1P15498 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms