Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RD3LP0DJH9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RD3LP0DJH9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms