Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLGNO14967 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLGNO14967 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLGNO14967 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLGNO14967 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLGNO14967 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms