Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC22A4Q9H015 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC22A4Q9H015 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms