Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PBDC1Q9BVG4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms