Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBM4BQ9BQ04 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RBM4BQ9BQ04 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms