Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MMP19Q99542 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms