Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZC2HC1AQ96GY0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms