Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMIGD2Q96BF3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMIGD2Q96BF3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms