Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC01551Q86U37 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms