Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PXDC1Q5TGL8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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