Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CAMK2DQ13557 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAMK2DQ13557 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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