Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MRPL28Q13084 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MRPL28Q13084 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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