Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GNB1P62873 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GNB1P62873 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GNB1P62873 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GNB1P62873 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms