Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11AP62491 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms