Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NR2F1P10589 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NR2F1P10589 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms