Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPTA1P02549 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPTA1P02549 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms