Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
U3KQ87 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
U3KQ87 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
U3KQ87 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U3KQ87 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
U3KQ87 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
U3KQ87 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
U3KQ87 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms