Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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