Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNIP3Q9Y2W7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms