Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms