Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GGA1Q9UJY5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GGA1Q9UJY5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms