Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C2orf88Q9BSF0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms