Protein–RNA interactions for Protein: Q96A22

C11orf52, Uncharacterized protein C11orf52, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf52Q96A22 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C11orf52Q96A22 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms