Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMEM229BQ8NBD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMEM229BQ8NBD8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms