Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRD3Q15059 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRD3Q15059 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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