Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMCO1Q147U7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SMCO1Q147U7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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