Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRIM25Q14258 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM25Q14258 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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