Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMDP57764 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms