Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2BFSP57053 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2BFSP57053 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms